دانلود مقاله با موضوع مجموعه در سطح کروموزوم از ژنوم Dermatophagoides farinae
در قالب pdf و در 27 اسلاید،قابل ویرایش، شامل:
موضوع به انگلیسی:Chromosome-level assembly of
Dermatophagoides farinae genome and
transcriptome reveals two novel allergens
Der f 37 and Der f 39
بخشی از متن:دادههای رونویسی و ژنوم کنه گرد و غبار خانگی (HDM) به درک ما کمک میکند
آلرژن های HDM ما به دنبال جمع آوری ژنوم در سطح کروموزوم و دقیق بودیم
رونوشت پروفایل Dermatophagoides farinae و شناسایی آلرژن های جدید در این مطالعه،
مواد ژنتیکی استخراج شده از اجسام HDM و تخمک ها توالی یابی شدند. خواندن های کوتاه از بعدی
توالی یابی نسل (NGS) و خواندن طولانی از توالی یابی PacBio/Nanopore برای
ژنوم هسته ای، رونوشت و ژنوم میتوکندری D. farinae را بسازید. نامزد
همولوگ ها از طریق تراز کردن داده های رونوشت مونتاژ شده ما با اسید آمینه غربال شدند
توالی ها در پایگاه داده WHO/IUIS. نتایج ما نشان داد که در مقایسه با پیش نویس D. farinae
ژنوم، محتوای DNA باکتریایی در توالییابیهای توسعهیافته در حال حاضر بهطور چشمگیری بود
کاهش یافت (از 22.9888٪ به 1.5585٪)، اندازه ژنوم اصلاح شد (از 53.55 Mb به 58.77 Mb)،
و Contig N50 افزایش یافت (از 8.54 کیلوبایت به 9365.49 کیلوبایت). ژنوم مونتاژ شده دارای 10 است
بیماری هایی با حداقل آلودگی میکروبی، 33 آلرژن معمولی و 2 آلرژن جدید. هشت
همولوگ (50٪ همسانی) شبیه سازی شد. 2 سرم آلرژیک HDM متصل و شناسایی شدند
آلرژن ها (Der f 37 و Der f 39). در نتیجه، یک ژنوم در سطح کروموزوم، رونوشت و
ژنوم میتوکندری D. farinae برای حمایت از شناسایی و توسعه آلرژن تولید شد
واکسن های تشخیصی و ایمونوتراپی