دانلود ترجمه مقاله KID- استفاده از الگوریتم سریع و کارآمد برای استخراج متن به منظور ایجاد اتوماتیک
ترجمه در قالب فایل Word و قابل ویرایش میباشد
سال انتشار:2010
تعداد صفحه ترجمه:23
تعداد صفحه فایل انگلیسی:15
موضوع انگلیسی :DKaItaDba s-e an algorithm for fast and efficient text mining
used to automatically generate a database
containing kinetic information of enzymes
موضوع فارسی: دانلود ترجمه مقاله KID- استفاده از الگوریتم سریع و کارآمد برای استخراج متن به منظور ایجاد اتوماتیک
چکیده انگلیسی:Abstract
Background: The amount of available biological information is rapidly increasing and the focus of biological research
has moved from single components to networks and even larger projects aiming at the analysis, modelling and
simulation of biological networks as well as large scale comparison of cellular properties. It is therefore essential that
biological knowledge is easily accessible. However, most information is contained in the written literature in an
unstructured way, so that methods for the systematic extraction of knowledge directly from the primary literature have
to be deployed.
Description: Here we present a text mining algorithm for the extraction of kinetic information such as KM, Ki, kcat etc. as
well as associated information such as enzyme names, EC numbers, ligands, organisms, localisations, pH and
temperatures. Using this rule- and dictionary-based approach, it was possible to extract 514,394 kinetic parameters of
13 categories (KM, Ki, kcat, kcat/KM, Vmax, IC50, S0.5, Kd, Ka, t1/2, pI, nH, specific activity, Vmax/KM) from about 17 million PubMed
abstracts and combine them with other data in the abstract.
A manual verification of approx. 1,000 randomly chosen results yielded a recall between 51% and 84% and a precision
ranging from 55% to 96%, depending of the category searched
چکیده فارسی:پیش زمینه: مقدار اطلاعات بیولوژیکی در دسترس به سرعت رو به افزایش بوده و تمرکز تحقیقات بیولوژیکی از بخش های مجزا به سمت شبکه ها و حتی پروژه های بزرگتر کشانده شده که هدف آن ها تجزیه و تحلیل، مدلسازی و شبیه سازی شبکه های بیولوژیکی و همچنین مقایسه در سطح بالای ویژگی های سلولی می باشد. بنابراین ضروری است تا اطلاعات بیولوژیکی به آسانی در دسترس باشد. به هر حال، بیشتر اطلاعات در تحقیقات انجام شده به صورت غیرساختاری بوده و به این خاطر روش هایی برای استخراج نظامند اطلاعات، مستقیما از تحقیقات اولیه می بایست توسعه یابد
